Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh3glb1Q9JK48 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3glb1Q9JK48 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3glb1Q9JK48 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3glb1Q9JK48 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3glb1Q9JK48 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3glb1Q9JK48 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3glb1Q9JK48 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3glb1Q9JK48 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3glb1Q9JK48 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3glb1Q9JK48 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3glb1Q9JK48 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3glb1Q9JK48 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3glb1Q9JK48 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3glb1Q9JK48 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3glb1Q9JK48 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3glb1Q9JK48 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3glb1Q9JK48 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3glb1Q9JK48 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3glb1Q9JK48 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.5 ms