Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmbr1Q9JIT0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmbr1Q9JIT0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmbr1Q9JIT0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmbr1Q9JIT0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Lmbr1Q9JIT0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmbr1Q9JIT0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmbr1Q9JIT0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmbr1Q9JIT0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmbr1Q9JIT0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmbr1Q9JIT0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmbr1Q9JIT0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmbr1Q9JIT0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmbr1Q9JIT0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmbr1Q9JIT0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmbr1Q9JIT0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmbr1Q9JIT0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmbr1Q9JIT0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmbr1Q9JIT0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmbr1Q9JIT0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmbr1Q9JIT0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmbr1Q9JIT0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmbr1Q9JIT0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmbr1Q9JIT0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmbr1Q9JIT0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmbr1Q9JIT0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmbr1Q9JIT0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmbr1Q9JIT0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmbr1Q9JIT0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmbr1Q9JIT0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmbr1Q9JIT0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmbr1Q9JIT0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmbr1Q9JIT0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmbr1Q9JIT0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmbr1Q9JIT0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmbr1Q9JIT0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmbr1Q9JIT0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmbr1Q9JIT0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmbr1Q9JIT0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmbr1Q9JIT0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmbr1Q9JIT0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmbr1Q9JIT0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmbr1Q9JIT0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmbr1Q9JIT0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmbr1Q9JIT0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmbr1Q9JIT0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmbr1Q9JIT0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmbr1Q9JIT0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmbr1Q9JIT0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmbr1Q9JIT0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmbr1Q9JIT0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmbr1Q9JIT0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.1 ms