Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIK5

Ddx21, Nucleolar RNA helicase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx21Q9JIK5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx21Q9JIK5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddx21Q9JIK5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx21Q9JIK5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx21Q9JIK5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddx21Q9JIK5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx21Q9JIK5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx21Q9JIK5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx21Q9JIK5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx21Q9JIK5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx21Q9JIK5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx21Q9JIK5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx21Q9JIK5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx21Q9JIK5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx21Q9JIK5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx21Q9JIK5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ddx21Q9JIK5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx21Q9JIK5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx21Q9JIK5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx21Q9JIK5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx21Q9JIK5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx21Q9JIK5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ddx21Q9JIK5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx21Q9JIK5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ddx21Q9JIK5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx21Q9JIK5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ddx21Q9JIK5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx21Q9JIK5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx21Q9JIK5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx21Q9JIK5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx21Q9JIK5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ddx21Q9JIK5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx21Q9JIK5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ddx21Q9JIK5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx21Q9JIK5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ddx21Q9JIK5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx21Q9JIK5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ddx21Q9JIK5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx21Q9JIK5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx21Q9JIK5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ddx21Q9JIK5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx21Q9JIK5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx21Q9JIK5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 481.9 ms