Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI71

Dll4, Delta-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll4Q9JI71 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dll4Q9JI71 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dll4Q9JI71 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dll4Q9JI71 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dll4Q9JI71 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dll4Q9JI71 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dll4Q9JI71 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dll4Q9JI71 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dll4Q9JI71 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dll4Q9JI71 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dll4Q9JI71 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dll4Q9JI71 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dll4Q9JI71 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dll4Q9JI71 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dll4Q9JI71 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dll4Q9JI71 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms