Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htr3bQ9JHJ5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htr3bQ9JHJ5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htr3bQ9JHJ5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htr3bQ9JHJ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htr3bQ9JHJ5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htr3bQ9JHJ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htr3bQ9JHJ5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htr3bQ9JHJ5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htr3bQ9JHJ5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htr3bQ9JHJ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htr3bQ9JHJ5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Htr3bQ9JHJ5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htr3bQ9JHJ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Htr3bQ9JHJ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Htr3bQ9JHJ5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htr3bQ9JHJ5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htr3bQ9JHJ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htr3bQ9JHJ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htr3bQ9JHJ5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr3bQ9JHJ5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr3bQ9JHJ5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr3bQ9JHJ5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr3bQ9JHJ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr3bQ9JHJ5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr3bQ9JHJ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms