Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI9

Slc40a1, Solute carrier family 40 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc40a1Q9JHI9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc40a1Q9JHI9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc40a1Q9JHI9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc40a1Q9JHI9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc40a1Q9JHI9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc40a1Q9JHI9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc40a1Q9JHI9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc40a1Q9JHI9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc40a1Q9JHI9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc40a1Q9JHI9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc40a1Q9JHI9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc40a1Q9JHI9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc40a1Q9JHI9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc40a1Q9JHI9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc40a1Q9JHI9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc40a1Q9JHI9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc40a1Q9JHI9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slc40a1Q9JHI9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc40a1Q9JHI9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc40a1Q9JHI9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc40a1Q9JHI9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc40a1Q9JHI9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc40a1Q9JHI9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc40a1Q9JHI9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc40a1Q9JHI9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms