Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC44.31■■■■■ 4.68
Rb1cc1Q9ESK9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
Rb1cc1Q9ESK9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Rb1cc1Q9ESK9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Rb1cc1Q9ESK9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Rb1cc1Q9ESK9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
Rb1cc1Q9ESK9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Rb1cc1Q9ESK9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
Rb1cc1Q9ESK9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
Rb1cc1Q9ESK9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Rb1cc1Q9ESK9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Rb1cc1Q9ESK9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Rb1cc1Q9ESK9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Rb1cc1Q9ESK9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Rb1cc1Q9ESK9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Rb1cc1Q9ESK9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
Rb1cc1Q9ESK9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
Rb1cc1Q9ESK9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
Rb1cc1Q9ESK9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC44.21■■■■■ 4.67
Rb1cc1Q9ESK9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
Rb1cc1Q9ESK9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
Rb1cc1Q9ESK9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Rb1cc1Q9ESK9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Rb1cc1Q9ESK9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Rb1cc1Q9ESK9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Rb1cc1Q9ESK9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Rb1cc1Q9ESK9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC44.14■■■■■ 4.66
Rb1cc1Q9ESK9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Rb1cc1Q9ESK9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Rb1cc1Q9ESK9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
Rb1cc1Q9ESK9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Rb1cc1Q9ESK9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Rb1cc1Q9ESK9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
Rb1cc1Q9ESK9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
Rb1cc1Q9ESK9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Rb1cc1Q9ESK9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC44.03■■■■■ 4.64
Rb1cc1Q9ESK9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Rb1cc1Q9ESK9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Rb1cc1Q9ESK9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
Rb1cc1Q9ESK9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Rb1cc1Q9ESK9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Rb1cc1Q9ESK9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC44.01■■■■■ 4.64
Rb1cc1Q9ESK9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Rb1cc1Q9ESK9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Rb1cc1Q9ESK9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
Rb1cc1Q9ESK9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC43.97■■■■■ 4.63
Rb1cc1Q9ESK9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Rb1cc1Q9ESK9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Rb1cc1Q9ESK9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Rb1cc1Q9ESK9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC43.94■■■■■ 4.62
Rb1cc1Q9ESK9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Rb1cc1Q9ESK9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
Rb1cc1Q9ESK9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Rb1cc1Q9ESK9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Rb1cc1Q9ESK9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Rb1cc1Q9ESK9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.61
Rb1cc1Q9ESK9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
Rb1cc1Q9ESK9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
Rb1cc1Q9ESK9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Rb1cc1Q9ESK9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Rb1cc1Q9ESK9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Rb1cc1Q9ESK9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Rb1cc1Q9ESK9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC43.83■■■■■ 4.61
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Rb1cc1Q9ESK9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC43.82■■■■■ 4.61
Rb1cc1Q9ESK9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Rb1cc1Q9ESK9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
Rb1cc1Q9ESK9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Rb1cc1Q9ESK9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC43.79■■■■■ 4.6
Rb1cc1Q9ESK9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
Rb1cc1Q9ESK9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Rb1cc1Q9ESK9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC43.78■■■■■ 4.6
Rb1cc1Q9ESK9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Rb1cc1Q9ESK9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms