Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp29Q9ES63 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp29Q9ES63 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp29Q9ES63 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp29Q9ES63 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp29Q9ES63 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp29Q9ES63 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp29Q9ES63 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp29Q9ES63 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp29Q9ES63 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp29Q9ES63 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp29Q9ES63 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp29Q9ES63 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp29Q9ES63 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp29Q9ES63 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp29Q9ES63 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp29Q9ES63 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp29Q9ES63 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp29Q9ES63 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp29Q9ES63 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp29Q9ES63 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp29Q9ES63 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp29Q9ES63 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp29Q9ES63 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp29Q9ES63 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp29Q9ES63 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp29Q9ES63 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp29Q9ES63 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp29Q9ES63 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp29Q9ES63 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp29Q9ES63 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp29Q9ES63 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp29Q9ES63 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp29Q9ES63 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp29Q9ES63 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp29Q9ES63 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp29Q9ES63 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp29Q9ES63 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp29Q9ES63 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp29Q9ES63 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp29Q9ES63 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp29Q9ES63 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp29Q9ES63 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp29Q9ES63 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp29Q9ES63 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp29Q9ES63 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp29Q9ES63 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp29Q9ES63 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp29Q9ES63 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp29Q9ES63 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp29Q9ES63 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp29Q9ES63 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp29Q9ES63 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp29Q9ES63 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp29Q9ES63 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp29Q9ES63 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp29Q9ES63 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp29Q9ES63 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp29Q9ES63 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp29Q9ES63 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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