Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spock2Q9ER58 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Spock2Q9ER58 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spock2Q9ER58 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spock2Q9ER58 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Spock2Q9ER58 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spock2Q9ER58 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spock2Q9ER58 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spock2Q9ER58 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spock2Q9ER58 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spock2Q9ER58 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spock2Q9ER58 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spock2Q9ER58 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spock2Q9ER58 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spock2Q9ER58 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Spock2Q9ER58 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spock2Q9ER58 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Spock2Q9ER58 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spock2Q9ER58 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spock2Q9ER58 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spock2Q9ER58 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spock2Q9ER58 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spock2Q9ER58 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spock2Q9ER58 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spock2Q9ER58 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spock2Q9ER58 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spock2Q9ER58 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spock2Q9ER58 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spock2Q9ER58 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spock2Q9ER58 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spock2Q9ER58 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spock2Q9ER58 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spock2Q9ER58 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spock2Q9ER58 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spock2Q9ER58 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spock2Q9ER58 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Spock2Q9ER58 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spock2Q9ER58 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms