Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Capn12Q9ER56 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capn12Q9ER56 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capn12Q9ER56 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capn12Q9ER56 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn12Q9ER56 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn12Q9ER56 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn12Q9ER56 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn12Q9ER56 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn12Q9ER56 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn12Q9ER56 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn12Q9ER56 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn12Q9ER56 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn12Q9ER56 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn12Q9ER56 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Capn12Q9ER56 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Capn12Q9ER56 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Capn12Q9ER56 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capn12Q9ER56 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn12Q9ER56 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn12Q9ER56 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms