Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW8

Ndst4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst4Q9EQW8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ndst4Q9EQW8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ndst4Q9EQW8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ndst4Q9EQW8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ndst4Q9EQW8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ndst4Q9EQW8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ndst4Q9EQW8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ndst4Q9EQW8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ndst4Q9EQW8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ndst4Q9EQW8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ndst4Q9EQW8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ndst4Q9EQW8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ndst4Q9EQW8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ndst4Q9EQW8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndst4Q9EQW8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ndst4Q9EQW8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ndst4Q9EQW8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndst4Q9EQW8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndst4Q9EQW8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndst4Q9EQW8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndst4Q9EQW8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Ndst4Q9EQW8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ndst4Q9EQW8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndst4Q9EQW8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndst4Q9EQW8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndst4Q9EQW8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndst4Q9EQW8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndst4Q9EQW8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndst4Q9EQW8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndst4Q9EQW8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndst4Q9EQW8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ndst4Q9EQW8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndst4Q9EQW8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndst4Q9EQW8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndst4Q9EQW8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndst4Q9EQW8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndst4Q9EQW8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndst4Q9EQW8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ndst4Q9EQW8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ndst4Q9EQW8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ndst4Q9EQW8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ndst4Q9EQW8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ndst4Q9EQW8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ndst4Q9EQW8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ndst4Q9EQW8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndst4Q9EQW8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndst4Q9EQW8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndst4Q9EQW8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ndst4Q9EQW8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ndst4Q9EQW8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ndst4Q9EQW8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndst4Q9EQW8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndst4Q9EQW8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndst4Q9EQW8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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