Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD19

Rassf7, Ras association domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf7Q9DD19 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rassf7Q9DD19 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rassf7Q9DD19 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rassf7Q9DD19 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rassf7Q9DD19 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rassf7Q9DD19 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rassf7Q9DD19 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rassf7Q9DD19 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rassf7Q9DD19 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rassf7Q9DD19 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rassf7Q9DD19 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rassf7Q9DD19 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rassf7Q9DD19 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rassf7Q9DD19 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rassf7Q9DD19 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rassf7Q9DD19 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rassf7Q9DD19 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rassf7Q9DD19 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rassf7Q9DD19 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rassf7Q9DD19 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rassf7Q9DD19 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rassf7Q9DD19 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rassf7Q9DD19 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rassf7Q9DD19 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rassf7Q9DD19 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rassf7Q9DD19 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rassf7Q9DD19 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rassf7Q9DD19 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rassf7Q9DD19 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rassf7Q9DD19 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rassf7Q9DD19 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rassf7Q9DD19 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rassf7Q9DD19 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rassf7Q9DD19 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rassf7Q9DD19 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms