Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Riok3Q9DBU3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Riok3Q9DBU3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Riok3Q9DBU3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Riok3Q9DBU3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Riok3Q9DBU3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Riok3Q9DBU3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Riok3Q9DBU3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Riok3Q9DBU3 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Riok3Q9DBU3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Riok3Q9DBU3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Riok3Q9DBU3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Riok3Q9DBU3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Riok3Q9DBU3 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Riok3Q9DBU3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Riok3Q9DBU3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Riok3Q9DBU3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Riok3Q9DBU3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Riok3Q9DBU3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Riok3Q9DBU3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms