Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc97Q9DBT3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc97Q9DBT3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc97Q9DBT3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc97Q9DBT3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc97Q9DBT3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms