Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem43Q9DBS1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem43Q9DBS1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem43Q9DBS1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem43Q9DBS1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem43Q9DBS1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem43Q9DBS1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem43Q9DBS1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem43Q9DBS1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem43Q9DBS1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem43Q9DBS1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem43Q9DBS1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmem43Q9DBS1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem43Q9DBS1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem43Q9DBS1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem43Q9DBS1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem43Q9DBS1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem43Q9DBS1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms