Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA9

Gtf2h1, General transcription factor IIH subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h1Q9DBA9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2h1Q9DBA9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2h1Q9DBA9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2h1Q9DBA9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2h1Q9DBA9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2h1Q9DBA9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2h1Q9DBA9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2h1Q9DBA9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2h1Q9DBA9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2h1Q9DBA9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2h1Q9DBA9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2h1Q9DBA9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2h1Q9DBA9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2h1Q9DBA9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2h1Q9DBA9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2h1Q9DBA9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2h1Q9DBA9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2h1Q9DBA9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2h1Q9DBA9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2h1Q9DBA9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2h1Q9DBA9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2h1Q9DBA9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2h1Q9DBA9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2h1Q9DBA9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2h1Q9DBA9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2h1Q9DBA9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2h1Q9DBA9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2h1Q9DBA9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2h1Q9DBA9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2h1Q9DBA9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2h1Q9DBA9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2h1Q9DBA9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2h1Q9DBA9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2h1Q9DBA9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2h1Q9DBA9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gtf2h1Q9DBA9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2h1Q9DBA9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms