Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB07

Ift46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift46Q9DB07 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ift46Q9DB07 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift46Q9DB07 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ift46Q9DB07 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift46Q9DB07 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ift46Q9DB07 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ift46Q9DB07 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift46Q9DB07 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift46Q9DB07 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift46Q9DB07 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift46Q9DB07 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift46Q9DB07 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift46Q9DB07 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift46Q9DB07 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift46Q9DB07 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift46Q9DB07 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift46Q9DB07 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift46Q9DB07 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift46Q9DB07 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift46Q9DB07 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift46Q9DB07 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift46Q9DB07 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.7 ms