Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnn3Q9DAW9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnn3Q9DAW9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnn3Q9DAW9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn3Q9DAW9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.4 ms