Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20,32■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20,31■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20,3■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,3■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,29■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20,28■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20,27■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20,27■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,27■□□□□ 0,84
Cmtm2aQ9DAR1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20,26■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,26■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20,25■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20,25■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20,24■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20,23■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,23■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20,22■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20,22■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Cmtm2aQ9DAR1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,2■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20,2■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20,18■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20,17■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,17■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20,15■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20,15■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Cmtm2aQ9DAR1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20,14■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,12■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20,11■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20,11■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20,09■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,08■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,08■□□□□ 0,81
Cmtm2aQ9DAR1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20,08■□□□□ 0,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,4 ms