Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cmtm2bQ9DAC0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm2bQ9DAC0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms