Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efhc1Q9D9T8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efhc1Q9D9T8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efhc1Q9D9T8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efhc1Q9D9T8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efhc1Q9D9T8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efhc1Q9D9T8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efhc1Q9D9T8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Efhc1Q9D9T8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efhc1Q9D9T8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Efhc1Q9D9T8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efhc1Q9D9T8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms