Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmco5aQ9D9D5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmco5aQ9D9D5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmco5aQ9D9D5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmco5aQ9D9D5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmco5aQ9D9D5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmco5aQ9D9D5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmco5aQ9D9D5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmco5aQ9D9D5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmco5aQ9D9D5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmco5aQ9D9D5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmco5aQ9D9D5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmco5aQ9D9D5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmco5aQ9D9D5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmco5aQ9D9D5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmco5aQ9D9D5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmco5aQ9D9D5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmco5aQ9D9D5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmco5aQ9D9D5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmco5aQ9D9D5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmco5aQ9D9D5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmco5aQ9D9D5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmco5aQ9D9D5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmco5aQ9D9D5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmco5aQ9D9D5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmco5aQ9D9D5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmco5aQ9D9D5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmco5aQ9D9D5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmco5aQ9D9D5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco5aQ9D9D5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmco5aQ9D9D5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms