Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cntd1Q9D995 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cntd1Q9D995 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cntd1Q9D995 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cntd1Q9D995 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms