Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V6

Syap1, Synapse-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syap1Q9D5V6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syap1Q9D5V6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syap1Q9D5V6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syap1Q9D5V6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syap1Q9D5V6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syap1Q9D5V6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syap1Q9D5V6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syap1Q9D5V6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syap1Q9D5V6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syap1Q9D5V6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syap1Q9D5V6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syap1Q9D5V6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syap1Q9D5V6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syap1Q9D5V6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syap1Q9D5V6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syap1Q9D5V6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syap1Q9D5V6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syap1Q9D5V6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Syap1Q9D5V6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Syap1Q9D5V6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Syap1Q9D5V6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syap1Q9D5V6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syap1Q9D5V6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syap1Q9D5V6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syap1Q9D5V6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syap1Q9D5V6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syap1Q9D5V6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syap1Q9D5V6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syap1Q9D5V6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syap1Q9D5V6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Syap1Q9D5V6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syap1Q9D5V6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms