Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lpcat2bQ9D5U0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Lpcat2bQ9D5U0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lpcat2bQ9D5U0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lpcat2bQ9D5U0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lpcat2bQ9D5U0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lpcat2bQ9D5U0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lpcat2bQ9D5U0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lpcat2bQ9D5U0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lpcat2bQ9D5U0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lpcat2bQ9D5U0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lpcat2bQ9D5U0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lpcat2bQ9D5U0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lpcat2bQ9D5U0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lpcat2bQ9D5U0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lpcat2bQ9D5U0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lpcat2bQ9D5U0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lpcat2bQ9D5U0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lpcat2bQ9D5U0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lpcat2bQ9D5U0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms