Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam227bQ9D518 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fam227bQ9D518 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam227bQ9D518 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam227bQ9D518 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam227bQ9D518 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam227bQ9D518 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam227bQ9D518 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam227bQ9D518 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam227bQ9D518 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam227bQ9D518 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam227bQ9D518 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam227bQ9D518 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam227bQ9D518 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam227bQ9D518 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam227bQ9D518 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam227bQ9D518 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam227bQ9D518 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam227bQ9D518 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam227bQ9D518 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam227bQ9D518 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam227bQ9D518 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam227bQ9D518 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam227bQ9D518 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam227bQ9D518 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam227bQ9D518 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam227bQ9D518 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam227bQ9D518 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam227bQ9D518 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam227bQ9D518 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam227bQ9D518 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam227bQ9D518 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam227bQ9D518 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms