Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc130Q9D516 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc130Q9D516 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc130Q9D516 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc130Q9D516 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms