Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpn3Q9D3W4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpn3Q9D3W4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpn3Q9D3W4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpn3Q9D3W4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpn3Q9D3W4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpn3Q9D3W4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpn3Q9D3W4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpn3Q9D3W4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gpn3Q9D3W4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpn3Q9D3W4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms