Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph14Q9D3W1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph14Q9D3W1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph14Q9D3W1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph14Q9D3W1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph14Q9D3W1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Rsph14Q9D3W1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rsph14Q9D3W1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rsph14Q9D3W1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms