Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx11Q9D3G5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx11Q9D3G5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx11Q9D3G5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx11Q9D3G5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms