Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt20Q9D312 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt20Q9D312 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt20Q9D312 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt20Q9D312 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt20Q9D312 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt20Q9D312 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt20Q9D312 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt20Q9D312 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt20Q9D312 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt20Q9D312 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt20Q9D312 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt20Q9D312 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt20Q9D312 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt20Q9D312 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt20Q9D312 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt20Q9D312 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt20Q9D312 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt20Q9D312 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt20Q9D312 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt20Q9D312 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt20Q9D312 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms