Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ToporslQ9D2F8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ToporslQ9D2F8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ToporslQ9D2F8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ToporslQ9D2F8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ToporslQ9D2F8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ToporslQ9D2F8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ToporslQ9D2F8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ToporslQ9D2F8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ToporslQ9D2F8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ToporslQ9D2F8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ToporslQ9D2F8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ToporslQ9D2F8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ToporslQ9D2F8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ToporslQ9D2F8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ToporslQ9D2F8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ToporslQ9D2F8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ToporslQ9D2F8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ToporslQ9D2F8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ToporslQ9D2F8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ToporslQ9D2F8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms