Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc167Q9D162 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc167Q9D162 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc167Q9D162 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc167Q9D162 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc167Q9D162 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc167Q9D162 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc167Q9D162 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc167Q9D162 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms