Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ribc1Q9D0B8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ribc1Q9D0B8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ribc1Q9D0B8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ribc1Q9D0B8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ribc1Q9D0B8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ribc1Q9D0B8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ribc1Q9D0B8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ribc1Q9D0B8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ribc1Q9D0B8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ribc1Q9D0B8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ribc1Q9D0B8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ribc1Q9D0B8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ribc1Q9D0B8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ribc1Q9D0B8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ribc1Q9D0B8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ribc1Q9D0B8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ribc1Q9D0B8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ribc1Q9D0B8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ribc1Q9D0B8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ribc1Q9D0B8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ribc1Q9D0B8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ribc1Q9D0B8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ribc1Q9D0B8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ribc1Q9D0B8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ribc1Q9D0B8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ribc1Q9D0B8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ribc1Q9D0B8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ribc1Q9D0B8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ribc1Q9D0B8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ribc1Q9D0B8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ribc1Q9D0B8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ribc1Q9D0B8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ribc1Q9D0B8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ribc1Q9D0B8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ribc1Q9D0B8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ribc1Q9D0B8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ribc1Q9D0B8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ribc1Q9D0B8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ribc1Q9D0B8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ribc1Q9D0B8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ribc1Q9D0B8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ribc1Q9D0B8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ribc1Q9D0B8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ribc1Q9D0B8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ribc1Q9D0B8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ribc1Q9D0B8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms