Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mis18aQ9CZJ6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Mis18aQ9CZJ6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mis18aQ9CZJ6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mis18aQ9CZJ6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mis18aQ9CZJ6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mis18aQ9CZJ6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mis18aQ9CZJ6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mis18aQ9CZJ6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mis18aQ9CZJ6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mis18aQ9CZJ6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mis18aQ9CZJ6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mis18aQ9CZJ6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms