Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssu72Q9CY97 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssu72Q9CY97 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssu72Q9CY97 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssu72Q9CY97 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssu72Q9CY97 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssu72Q9CY97 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssu72Q9CY97 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssu72Q9CY97 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssu72Q9CY97 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssu72Q9CY97 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssu72Q9CY97 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssu72Q9CY97 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms