Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH3

3300002I08Rik, RIKEN cDNA 3300002I08, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3300002I08RikQ9CXH3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
3300002I08RikQ9CXH3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
3300002I08RikQ9CXH3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
3300002I08RikQ9CXH3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
3300002I08RikQ9CXH3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
3300002I08RikQ9CXH3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
3300002I08RikQ9CXH3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
3300002I08RikQ9CXH3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
3300002I08RikQ9CXH3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
3300002I08RikQ9CXH3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
3300002I08RikQ9CXH3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
3300002I08RikQ9CXH3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
3300002I08RikQ9CXH3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
3300002I08RikQ9CXH3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
3300002I08RikQ9CXH3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
3300002I08RikQ9CXH3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
3300002I08RikQ9CXH3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
3300002I08RikQ9CXH3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
3300002I08RikQ9CXH3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
3300002I08RikQ9CXH3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
3300002I08RikQ9CXH3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
3300002I08RikQ9CXH3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms