Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BccipQ9CWI3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BccipQ9CWI3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BccipQ9CWI3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BccipQ9CWI3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BccipQ9CWI3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BccipQ9CWI3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BccipQ9CWI3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BccipQ9CWI3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BccipQ9CWI3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BccipQ9CWI3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BccipQ9CWI3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BccipQ9CWI3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BccipQ9CWI3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BccipQ9CWI3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BccipQ9CWI3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BccipQ9CWI3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BccipQ9CWI3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BccipQ9CWI3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BccipQ9CWI3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BccipQ9CWI3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms