Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVN6

Cby3, Protein chibby homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cby3Q9CVN6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cby3Q9CVN6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cby3Q9CVN6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cby3Q9CVN6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cby3Q9CVN6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cby3Q9CVN6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cby3Q9CVN6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cby3Q9CVN6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cby3Q9CVN6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cby3Q9CVN6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cby3Q9CVN6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cby3Q9CVN6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cby3Q9CVN6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cby3Q9CVN6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cby3Q9CVN6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cby3Q9CVN6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cby3Q9CVN6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cby3Q9CVN6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cby3Q9CVN6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cby3Q9CVN6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cby3Q9CVN6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cby3Q9CVN6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cby3Q9CVN6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cby3Q9CVN6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cby3Q9CVN6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cby3Q9CVN6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cby3Q9CVN6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cby3Q9CVN6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cby3Q9CVN6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cby3Q9CVN6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cby3Q9CVN6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cby3Q9CVN6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms