Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Atxn3Q9CVD2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Atxn3Q9CVD2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Atxn3Q9CVD2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Atxn3Q9CVD2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Atxn3Q9CVD2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Atxn3Q9CVD2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Atxn3Q9CVD2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Atxn3Q9CVD2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Atxn3Q9CVD2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Atxn3Q9CVD2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Atxn3Q9CVD2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Atxn3Q9CVD2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Atxn3Q9CVD2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Atxn3Q9CVD2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Atxn3Q9CVD2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Atxn3Q9CVD2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Atxn3Q9CVD2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Atxn3Q9CVD2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Atxn3Q9CVD2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Atxn3Q9CVD2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Atxn3Q9CVD2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Atxn3Q9CVD2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Atxn3Q9CVD2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Atxn3Q9CVD2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Atxn3Q9CVD2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Atxn3Q9CVD2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Atxn3Q9CVD2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Atxn3Q9CVD2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Atxn3Q9CVD2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Atxn3Q9CVD2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Atxn3Q9CVD2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Atxn3Q9CVD2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Atxn3Q9CVD2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Atxn3Q9CVD2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Atxn3Q9CVD2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Atxn3Q9CVD2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Atxn3Q9CVD2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Atxn3Q9CVD2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Atxn3Q9CVD2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Atxn3Q9CVD2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Atxn3Q9CVD2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Atxn3Q9CVD2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Atxn3Q9CVD2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Atxn3Q9CVD2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Atxn3Q9CVD2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Atxn3Q9CVD2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Atxn3Q9CVD2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Atxn3Q9CVD2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Atxn3Q9CVD2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Atxn3Q9CVD2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Atxn3Q9CVD2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Atxn3Q9CVD2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Atxn3Q9CVD2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Atxn3Q9CVD2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Atxn3Q9CVD2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Atxn3Q9CVD2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Atxn3Q9CVD2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Atxn3Q9CVD2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Atxn3Q9CVD2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Atxn3Q9CVD2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Atxn3Q9CVD2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Atxn3Q9CVD2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Atxn3Q9CVD2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Atxn3Q9CVD2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Atxn3Q9CVD2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Atxn3Q9CVD2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Atxn3Q9CVD2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atxn3Q9CVD2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atxn3Q9CVD2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atxn3Q9CVD2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atxn3Q9CVD2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atxn3Q9CVD2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms