Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sppl3Q9CUS9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sppl3Q9CUS9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sppl3Q9CUS9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sppl3Q9CUS9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sppl3Q9CUS9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sppl3Q9CUS9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sppl3Q9CUS9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sppl3Q9CUS9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sppl3Q9CUS9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sppl3Q9CUS9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sppl3Q9CUS9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sppl3Q9CUS9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Sppl3Q9CUS9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sppl3Q9CUS9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sppl3Q9CUS9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sppl3Q9CUS9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sppl3Q9CUS9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sppl3Q9CUS9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sppl3Q9CUS9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sppl3Q9CUS9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sppl3Q9CUS9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sppl3Q9CUS9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sppl3Q9CUS9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sppl3Q9CUS9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sppl3Q9CUS9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Sppl3Q9CUS9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sppl3Q9CUS9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Sppl3Q9CUS9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sppl3Q9CUS9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sppl3Q9CUS9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sppl3Q9CUS9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sppl3Q9CUS9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sppl3Q9CUS9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sppl3Q9CUS9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sppl3Q9CUS9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sppl3Q9CUS9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sppl3Q9CUS9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Sppl3Q9CUS9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sppl3Q9CUS9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sppl3Q9CUS9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Sppl3Q9CUS9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sppl3Q9CUS9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sppl3Q9CUS9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sppl3Q9CUS9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sppl3Q9CUS9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sppl3Q9CUS9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sppl3Q9CUS9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sppl3Q9CUS9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sppl3Q9CUS9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sppl3Q9CUS9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sppl3Q9CUS9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sppl3Q9CUS9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sppl3Q9CUS9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sppl3Q9CUS9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sppl3Q9CUS9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sppl3Q9CUS9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sppl3Q9CUS9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sppl3Q9CUS9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Sppl3Q9CUS9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sppl3Q9CUS9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sppl3Q9CUS9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sppl3Q9CUS9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sppl3Q9CUS9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sppl3Q9CUS9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sppl3Q9CUS9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sppl3Q9CUS9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sppl3Q9CUS9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sppl3Q9CUS9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sppl3Q9CUS9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sppl3Q9CUS9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sppl3Q9CUS9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sppl3Q9CUS9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sppl3Q9CUS9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sppl3Q9CUS9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sppl3Q9CUS9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sppl3Q9CUS9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sppl3Q9CUS9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sppl3Q9CUS9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sppl3Q9CUS9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sppl3Q9CUS9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sppl3Q9CUS9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms