Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp13a2Q9CTG6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp13a2Q9CTG6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp13a2Q9CTG6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp13a2Q9CTG6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms