Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cldnd1Q9CQX5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cldnd1Q9CQX5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cldnd1Q9CQX5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cldnd1Q9CQX5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cldnd1Q9CQX5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cldnd1Q9CQX5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cldnd1Q9CQX5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cldnd1Q9CQX5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cldnd1Q9CQX5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cldnd1Q9CQX5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cldnd1Q9CQX5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cldnd1Q9CQX5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cldnd1Q9CQX5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cldnd1Q9CQX5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cldnd1Q9CQX5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cldnd1Q9CQX5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cldnd1Q9CQX5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cldnd1Q9CQX5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cldnd1Q9CQX5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cldnd1Q9CQX5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cldnd1Q9CQX5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldnd1Q9CQX5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldnd1Q9CQX5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cldnd1Q9CQX5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cldnd1Q9CQX5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cldnd1Q9CQX5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cldnd1Q9CQX5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cldnd1Q9CQX5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cldnd1Q9CQX5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cldnd1Q9CQX5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cldnd1Q9CQX5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cldnd1Q9CQX5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cldnd1Q9CQX5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cldnd1Q9CQX5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cldnd1Q9CQX5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cldnd1Q9CQX5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms