Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT9

Uncharacterized protein C20orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQT9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQT9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQT9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQT9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQT9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQT9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CQT9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CQT9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CQT9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CQT9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQT9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQT9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQT9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQT9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQT9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQT9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQT9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQT9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQT9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQT9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQT9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQT9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQT9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms