Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl49Q9CQ40 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mrpl49Q9CQ40 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mrpl49Q9CQ40 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mrpl49Q9CQ40 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
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