Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Commd4Q9CQ02 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Commd4Q9CQ02 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Commd4Q9CQ02 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Commd4Q9CQ02 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Commd4Q9CQ02 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Commd4Q9CQ02 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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