Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ3

Uncharacterized protein C1orf185 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPZ3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CPZ3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CPZ3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CPZ3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CPZ3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CPZ3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CPZ3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CPZ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CPZ3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9CPZ3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9CPZ3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9CPZ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CPZ3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CPZ3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CPZ3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CPZ3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CPZ3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CPZ3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CPZ3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CPZ3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9CPZ3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9CPZ3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CPZ3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CPZ3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CPZ3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CPZ3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q9CPZ3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CPZ3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CPZ3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CPZ3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms