Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 PISD-204ENST00000422020 1015 ntTSL 512.77□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 PISD-207ENST00000435900 1723 ntTSL 512.73□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 PISD-201ENST00000266095 2655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.384e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 LAMTOR2-201ENST00000368302 587 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.454e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 LAMTOR2-202ENST00000368304 521 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.474e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 SSBP2-219ENST00000515395 1398 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.574e-11■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 SSBP2-205ENST00000505980 1521 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.754e-11■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.824e-11■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 SSBP2-212ENST00000509053 1534 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.924e-11■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 SSBP2-211ENST00000509013 709 ntTSL 57.13□□□□□ -1.274e-11■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 SSBP2-210ENST00000508912 256 ntTSL 26.55□□□□□ -1.364e-11■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 SSBP2-206ENST00000506960 685 ntTSL 23.55□□□□□ -1.844e-11■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.954e-7■■■■■ 28.2
FTOQ9C0B1 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 28.2
FTOQ9C0B1 RILPL1-201ENST00000340724 2389 ntTSL 516.71■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 28.2
FTOQ9C0B1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.224e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.994e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 RBCK1-205ENST00000400245 1024 ntTSL 320.84■□□□□ 0.934e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.94e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.874e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 RBCK1-209ENST00000415942 2613 ntTSL 520.37■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 INF2-206ENST00000477497 545 ntTSL 320.23■□□□□ 0.834e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.754e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 RBCK1-210ENST00000441733 961 ntTSL 519.72■□□□□ 0.754e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.694e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.634e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 RBCK1-204ENST00000382214 2752 ntTSL 1 (best)18.78■□□□□ 0.64e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.584e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.494e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 RBCK1-211ENST00000465226 372 ntTSL 317.77■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 PPP1R21-203ENST00000416913 3208 ntTSL 217■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 INF2-201ENST00000252527 3050 ntTSL 216.73■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 RBCK1-207ENST00000411647 593 ntTSL 311.49□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 PPP1R21-205ENST00000431614 2481 ntTSL 511.31□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 28.1
FTOQ9C0B1 ARHGEF2-217ENST00000497907 764 ntTSL 322.35■■□□□ 1.174e-6■■■■■ 27.9
FTOQ9C0B1 ARHGEF2-216ENST00000495070 571 ntTSL 419.27■□□□□ 0.684e-6■■■■■ 27.9
FTOQ9C0B1 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 27.9
FTOQ9C0B1 ARHGEF2-213ENST00000476273 668 ntTSL 315.98■□□□□ 0.154e-6■■■■■ 27.9
FTOQ9C0B1 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 27.9
FTOQ9C0B1 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.094e-6■■■■■ 27.9
FTOQ9C0B1 ARHGEF2-202ENST00000313695 4080 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 27.9
FTOQ9C0B1 ARHGEF2-211ENST00000471589 892 ntTSL 512.97□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 27.9
FTOQ9C0B1 ARHGEF2-207ENST00000465079 693 ntTSL 212.91□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 27.9
FTOQ9C0B1 ARHGEF2-214ENST00000477754 883 ntTSL 56.96□□□□□ -1.34e-6■■■■■ 27.9
FTOQ9C0B1 C1orf159-212ENST00000467751 2099 ntTSL 221.71■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 27.8
FTOQ9C0B1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.961e-7■■■■■ 27.8
FTOQ9C0B1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.941e-7■■■■■ 27.8
FTOQ9C0B1 C1orf159-207ENST00000434641 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.2■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 27.8
FTOQ9C0B1 C1orf159-218ENST00000482816 982 ntTSL 519.61■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 27.8
FTOQ9C0B1 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 219.27■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 27.8
FTOQ9C0B1 C1orf159-215ENST00000475119 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.56■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 27.8
FTOQ9C0B1 C1orf159-209ENST00000462097 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.02■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 27.8
FTOQ9C0B1 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 216.19■□□□□ 0.181e-7■■■■■ 27.8
FTOQ9C0B1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.672e-7■■■■■ 27.6
FTOQ9C0B1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 27.6
FTOQ9C0B1 CALR-207ENST00000590325 781 ntTSL 216.07■□□□□ 0.161e-13■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.253e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.153e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 MXI1-208ENST00000460667 782 ntTSL 327.38■■□□□ 1.973e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 ZNF639-207ENST00000491818 1228 ntTSL 527.38■■□□□ 1.973e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.873e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.823e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 WDR34-202ENST00000419989 745 ntTSL 526.25■■□□□ 1.793e-6■■■■■ 27.5
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FTOQ9C0B1 HTRA2-203ENST00000437202 1479 ntTSL 1 (best)25.91■■□□□ 1.743e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.733e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 WDR34-203ENST00000451652 1039 ntTSL 224.03■■□□□ 1.443e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 MARF1-206ENST00000548216 2529 ntTSL 521.86■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 ZNF639-204ENST00000481587 584 ntTSL 319.81■□□□□ 0.763e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 HTRA2-204ENST00000462909 1294 ntTSL 319.01■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 HTRA2-210ENST00000484881 740 ntTSL 517.65■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 MXI1-206ENST00000442296 634 ntTSL 514.37□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 HTRA2-206ENST00000467961 1323 ntTSL 512.72□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 MARF1-205ENST00000548025 5891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 MARF1-211ENST00000551742 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 MARF1-202ENST00000540441 7105 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.93e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 MXI1-209ENST00000484030 838 ntTSL 58.14□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 ZFPM2-204ENST00000518180 596 ntTSL 44□□□□□ -1.773e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 PLEC-209ENST00000526416 583 ntTSL 319.02■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 PLEC-212ENST00000527816 583 ntTSL 315.16■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.663e-9■■■■■ 27.5
FTOQ9C0B1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 27.4
FTOQ9C0B1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.262e-9■■■■■ 27.4
FTOQ9C0B1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.12e-9■■■■■ 27.4
FTOQ9C0B1 NT5DC2-215ENST00000492555 2004 ntTSL 1 (best)20.88■□□□□ 0.932e-9■■■■■ 27.4
FTOQ9C0B1 NT5DC2-212ENST00000487779 536 ntTSL 314.33□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 27.4
FTOQ9C0B1 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.162e-9■■■■■ 27.4
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