Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH7

Slc26a5, Prestin, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a5Q99NH7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc26a5Q99NH7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc26a5Q99NH7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc26a5Q99NH7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc26a5Q99NH7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc26a5Q99NH7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc26a5Q99NH7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc26a5Q99NH7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc26a5Q99NH7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc26a5Q99NH7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc26a5Q99NH7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc26a5Q99NH7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms