Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cep41Q99NF3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cep41Q99NF3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cep41Q99NF3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cep41Q99NF3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cep41Q99NF3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cep41Q99NF3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cep41Q99NF3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep41Q99NF3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep41Q99NF3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep41Q99NF3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep41Q99NF3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep41Q99NF3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep41Q99NF3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep41Q99NF3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep41Q99NF3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep41Q99NF3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep41Q99NF3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep41Q99NF3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep41Q99NF3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep41Q99NF3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep41Q99NF3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep41Q99NF3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep41Q99NF3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep41Q99NF3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep41Q99NF3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep41Q99NF3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep41Q99NF3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep41Q99NF3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep41Q99NF3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep41Q99NF3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep41Q99NF3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep41Q99NF3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep41Q99NF3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep41Q99NF3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep41Q99NF3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep41Q99NF3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep41Q99NF3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep41Q99NF3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep41Q99NF3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep41Q99NF3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cep41Q99NF3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cep41Q99NF3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cep41Q99NF3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cep41Q99NF3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cep41Q99NF3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cep41Q99NF3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cep41Q99NF3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cep41Q99NF3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cep41Q99NF3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cep41Q99NF3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cep41Q99NF3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms